Martn Corts naci en la ciudad de Cuernavaca, hoy Estado de Morelos en 1533. Hered de su padre el ttulo nobiliario de segundo marqus del Valle de Oaxaca. Su madre fue la espaola Juana Ziga, por lo que en el sistema de castas estaba clasificado como criollo. Cabe mencionar que tuvo un hermano con el mismo nombre, Martn Corts Malintzin, El Mestizo, quien fue hijo de Hernn y la Malinche. Ambos hermanos se criaron juntos y tuvieron una relacin estrecha.
Viaj a Espaa junto a su padre en 1540, y se puso a las rdenes de los reyes Carlos I y Felipe II. Debido a ello particip en las expediciones militares de San Quintn y Pases Bajos. En el viaje tambin se embarc Martn ?El Mestizo? y su hermana Juana Ziga. En 1547 Hernn Corts falleci en Espaa en medio de un conflicto por su intencin de hacerse con el poder del virreinato.
Martn mantuvo una vida cercana a la aristocracia, entre ellos el escritor Francisco Lpez de Gmora, quien escribi la Historia general de las Indias.
Martn Corts, primer criollo rebelde de la Nueva Espaa
En 1563 Martn Corts decidi regresar a la Nueva Espaa, lo acompaaban sus hermanos Martn y Luis. En ese momento era considerado el hombre ms rico del virreinato. La aprobacin de las Leyes Nuevas prohiba que los hijos de conquistadores heredaran encomiendas, lo que afectaba econmicamente a la familia de Corts. Debido a ello, inici un movimiento que permitiera que permitiera la autonoma de la administracin de la Nueva Espaa. Dicho episodio fue conocido como La Conspiracin de Martn Corts.
A la muerte del virrey Luis de Velazco y Ruiz de Alarcón en 1564, Martín fue nombrado capitán general por el ayuntamiento de la Nueva España (actual Ciudad de México). Inmediatamente tuvo un enfrentamiento con la audiencia, en el que Cortés insinuó sus intenciones de independizar el virreinato. En 1565 se levantó una sublevación de encomenderos en la que quisieron coronarle como rey de la Nueva España.
Como consecuencia se arrestó a Martín Cortés y a Alonso Ávila, hombre rico del virreinato. En julio de 1566 también quedaron detenidos sus hermanos Martín ?El Mestizo? y Luis. A todos se les sentenció a muerte, pero las vidas de los hermanos Cortés se salvaron por intervención del nuevo virrey, Gastón de Peralta y Bosquet.
Por su parte, Gil González de Ávila y Alonso de Ávila, quienes también eran descendientes de conquistadores, no tuvieron la misma suerte. Se dio la orden de cortar sus cabezas y exhibirlas frente al Palacio del Ayuntamiento.
Los abusos del visitador Alonso Muñoz
Debido al conflicto, el rey Felipe II envió como visita extraordinaria al licenciado Alonso Muñoz. Una vez en la Nueva España, el representante de Felipe II destituyó al virrey por deslealtad y lo desterró a España. Muñoz continuó con el encarcelamiento y la ejecución de sublevados.
La actitud sanguinaria del visitador Alonso Muñoz llegó a tal grado que descuartizó a algunos detenidos. Asimismo, torturó a Martín Cortés ?El Mestizo? con golpes y dando la orden de obligarlo a beber grandes cantidades de agua. Cuando el rey Felipe II se enteró de las torturas de la Nueva España en 1568 giró una orden para que Muñoz regresara inmediatamente. Felipe II reprochó directamente a Muñoz su conducta; un día después el visitador yacía muerto en su habitación.
Cuando Martín Cortés regresó a España en 1567 se le procesó, pagó una alta multa y se le confiscaron sus propiedades. Estuvo desterrado en Orán. Para 1574 se le otorgó una amnistía y pudo recuperar sus bienes, sin embargo, Nueva España le estaba vedada. Martín Cortés murió en 1589 en Madrid, España.